Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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