Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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