Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 214.01□□□□□ -0.173e-11■□□□□ 8.8
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TARDBPQ13148 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 212.43□□□□□ -0.423e-11■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 312.37□□□□□ -0.433e-11■□□□□ 8.8
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TARDBPQ13148 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-11■□□□□ 8.8
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TARDBPQ13148 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.695e-8■□□□□ 8.5
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TARDBPQ13148 ATP1B3-203ENST00000465172 1951 ntTSL 27.23□□□□□ -1.253e-7■□□□□ 8.3
TARDBPQ13148 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.263e-7■□□□□ 8.3
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TARDBPQ13148 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.732e-7■□□□□ 8.3
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TARDBPQ13148 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.938e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 ENTPD4-204ENST00000518471 790 ntTSL 419.18■□□□□ 0.668e-6■□□□□ 8.2
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TARDBPQ13148 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.148e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 ENTPD4-208ENST00000521321 579 ntTSL 415.87■□□□□ 0.138e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 ENTPD4-211ENST00000523958 2026 ntTSL 215.46■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.048e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.298e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.378e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.498e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 MKRN3-205ENST00000570112 470 ntTSL 210.83□□□□□ -0.688e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 MKRN3-204ENST00000568945 2740 ntTSL 49.95□□□□□ -0.828e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-205ENST00000444799 1590 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.838e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-204ENST00000417009 350 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.888e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-206ENST00000449279 699 ntTSL 39.47□□□□□ -0.898e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-214ENST00000613919 610 ntTSL 29.23□□□□□ -0.938e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.948e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -18e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.078e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 ENTPD4-210ENST00000522913 573 ntTSL 38.18□□□□□ -1.18e-6■□□□□ 8.2
TARDBPQ13148 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.148e-6■□□□□ 8.2
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