Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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