Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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