Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms