Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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