Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMAN2Q12907 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMAN2Q12907 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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