Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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