Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFCP2Q12800 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TFCP2Q12800 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFCP2Q12800 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms