Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFQ10587 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TEFQ10587 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TEFQ10587 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TEFQ10587 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TEFQ10587 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TEFQ10587 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TEFQ10587 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TEFQ10587 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TEFQ10587 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms