Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD300CQ08708 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms