Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLGA3Q08378 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms