Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms