Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FMODQ06828 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms