Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPN11Q06124 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPN11Q06124 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms