Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms