Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms