Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms