Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKL1Q00532 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms