Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2BQ00403 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms