Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2BP67870 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms