Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM15P57071 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRDM15P57071 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM15P57071 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms