Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP98P52948 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP98P52948 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP98P52948 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP98P52948 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms