Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1P51787 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNQ1P51787 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms