Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DNA2P51530 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DNA2P51530 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DNA2P51530 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DNA2P51530 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DNA2P51530 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DNA2P51530 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DNA2P51530 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DNA2P51530 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DNA2P51530 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DNA2P51530 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DNA2P51530 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DNA2P51530 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DNA2P51530 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms