Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORCP51449 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RORCP51449 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RORCP51449 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORCP51449 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms