Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP4P49662 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms