Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms