Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms