Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB10P40306 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB10P40306 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms