Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms