Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJC1P36383 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJC1P36383 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJC1P36383 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJC1P36383 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJC1P36383 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GJC1P36383 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJC1P36383 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJC1P36383 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJC1P36383 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJC1P36383 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms