Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP214P35658 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP214P35658 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms