Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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