Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNB1P35222 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNB1P35222 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms