Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF4P34130 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms