Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCC1P33527 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms