Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA3P32297 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms