Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms