Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKBRP32239 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKBRP32239 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms