Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1FP30939 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1FP30939 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms