Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSFA2P28290 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSFA2P28290 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms