Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms