Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2P24941 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2P24941 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2P24941 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2P24941 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms