Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRGP23470 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms