Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALB2P22676 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALB2P22676 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALB2P22676 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms