Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNA2P20248 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms