Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP2B1P20020 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP2B1P20020 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms