Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNNI3P19429 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms